Kandidati za sljedećeg rektora Zagrebačkog sveučilišta su dekan FER-a prof.dr. Vedran Mornar, dosadašnji rektor, dekan varaždinskog FOI-a prof.dr. Tihomir Hunjak i dosadašnji rektor, fizičar prof.dr. Aleksa Bjeliš.
Među kandidatima za rektora bio je i Neven Budak, dekan Filozofskog fakulteta, no on je ispao, s obzirom da je društveno-humanističko područje trebalo dati samo jednog kandidata, a to je Hunjak. Bjeliš predstavlja biomedicinsko i prirodoslovno područje, a Mornar tehničko. Programi kandidata mogu se pronaći na sljedećim linkovima: Mornar (PDF), Hunjak (PDF), Bjeliš (PDF).
Novi rektor bit će izabran tajnim glasovanjem 15. travnja 2010. godine u Auli Rektorata Sveučilišta u Zagrebu. Ne bude li ni jedan kandidat imao natpolovičnu većinu, u drugi krug ulaze dva kandidata s najvećim brojem glasova.
Splitsko sveučilište također će uskoro birati rektora, a o kojim kandidatima će se tamo raditi znat će se nakon 14. travnja do kad traje rok za dostavu prijedloga kandidata.